Endüstri Mühendisliği Bölümü 1972 yılında Ege Üniversitesi Mühendislik Bilimleri Fakültesi bünyesinde Kemal Karhan, İlter Akat, ve Gündüz Balkan tarafından kurulmuştur. Bölüm, 1978 yılında Ege Üniversitesi Makine Fakültesine bağlanmıştır. 1983 yılında Dokuz Eylül Üniversitesi Mühendislik Fakültesi bünyesinde yer almıştır.  Bölümümüze Fen Bilimleri Enstitüsü’ne bağlı olarak lisans üstü programlar yürütülmektedir. Bölümün lisans eğitim dili TÜRKÇE olup, yüksek lisans ve doktora eğitimi İngilizce olarak sürdürülmektedir. Bölümümüze bağlı iki Anabilim Dalı bulunmaktadır. Bunlar;

Endüstri Mühendisliği Anabilim Dalı

Anabilim Dalı Başkanı: Prof. Dr. Şeyda A. TOPALOĞLU YILDIZ

Yöneylem Araştırması Anabilim Dalı

Anabilim Dalı Başkanı:Prof. Dr. Adil BAYKASOĞLU

Sırasıyla aşağıda yer alan kişiler Bölüm Başkanlığı görevini yerine getirmiştir:

• 1974 – 1975 Prof. Dr. Kemal KARHAN
• 1975 – 1985 Prof. Dr. Gündüz BALKAN
• 1985 – 1989 Prof. Dr. Kutlu ZORAL
• 1989 – 1997 Prof. Dr. Demir ASLAN
• 1997 – 2004 Prof. Dr. Hasan ESKİ
• 2004 – 2007 Prof. Dr. Edip TEKER
• 2007 – 2010 Prof. Dr. Hasan ESKİ
• 2010 – 2011 Prof. Dr. G.Miraç BAYHAN
• 2011 – 2023 Prof. Dr. Adil BAYKASOĞLU
• 2023 – (Devam) Prof. Dr. Şeyda A. TOPALOĞLU YILDIZ